APLIKASI METODE UPGMA UNTUK IDENTIFIKASI KEKERABATAN JENIS VIRUS DAN PENYEBARAN EPIDEMI EBOLA MELALUI PEMBENTUKAN POHON FILOGENETIK

TRI ANDRIANI, - (2016) APLIKASI METODE UPGMA UNTUK IDENTIFIKASI KEKERABATAN JENIS VIRUS DAN PENYEBARAN EPIDEMI EBOLA MELALUI PEMBENTUKAN POHON FILOGENETIK. Masters thesis, Institut Teknologi Sepuluh Nopember.

[img]
Preview
Text
1213201045-Abstract.pdf - Published Version

Download (787kB) | Preview
[img]
Preview
Text
1213201045-Master Thesis.pdf - Published Version

Download (8MB) | Preview
[img]
Preview
Text
1213201045-conclusion.pdf - Published Version

Download (468kB) | Preview

Abstract

Penyakit ebola atau dalam bahasa medis Ebola Virus Disease (EVD) adalah penyakit yang disebabkan oleh sejenis virus dari genus Ebolavirus (EBOV), famili Filoviridae. Virus ebola diklasifikasikan ke dalam 5 jenis, yaitu Zaire ebolavirus (ZEBOV), Sudan ebolavirus (SEBOV), Bundibugyo ebolavirus (BEBOV), Tai Forest ebolavirus yang juga dikenal sebagai Cote d’Ivoire ebolavirus (CIEBOV), dan Reston ebolavirus (REBOV). Identifikasi kekerabatan jenis virus ebola dan penyebarannya dapat dilakukan dengan menggunakan pohon filogenetik. Pada penelitian ini, pohon filogenetik dibangun dengan Metode UPGMA yang didalamnya terdapat Multiple Alignment. Multiple Alignment menggunakan Metode Progressive yang didalamnya terdapat pensejajaran berpasangan menggunakan Algoritma Needleman Wunsch. Hasil pembentukan pohon fillogenetik disimpulkan bahwa hubungan kekerabatan jenis virus ebola tidak dapat disimpulkan secara umum, sebab tergantung pada type protein yang dibandingkan.. Misal pada type minor nucleoprotein jenis Zaire ebolavirus dekat dengan Sudan ebolavirus. Pada type membrane associated protein VP 24 jenis Zaire ebolavirus dekat dengan Bundibugyo ebolavirus. Berdasarkan pohon filogenetik data DNA, jenis Tai Forest ebolavirus dekat dengan Bundibugyo ebolavirus tetapi letak negara penyebaran epidemi ebola berjauhan. Jarak genetik untuk jenis Bundibugyo ebolavirus dengan Tai Forest ebolavirus adalah 0.3725. Jenis Tai Forest ebolavirus mirip dengan Bundibugyo ebolavirus tidak dipengaruhi oleh kedekatan daerah penyebaran epidemi ebola.

Item Type: Thesis (Masters)
Additional Information: RTMa 575.642 Tri a
Uncontrolled Keywords: metode upgma, multiple alignment, pohon filogenetik, virus ebola
Subjects: Q Science
Q Science > QA Mathematics
Q Science > QA Mathematics > QA75 Electronic computers. Computer science. EDP
Q Science > QA Mathematics > QA76 Computer software
Divisions: Faculty of Mathematics and Science > Mathematics > (S2) Master Theses
Depositing User: Mr. Tondo Indra Nyata
Date Deposited: 28 Dec 2016 06:47
Last Modified: 27 Dec 2018 07:54
URI: http://repository.its.ac.id/id/eprint/1225

Actions (login required)

View Item View Item