AKTIVITAS SENYAWA ALKALOID SA2014 DARI SPONS LAUT CINACHYRELLA ANOMALA TERHADAP PROTEIN P53 KANKER PAYUDARA T47D MENGGUNAKAN DOCKING MOLEKULER

LIANINGSIH, FITRI (2016) AKTIVITAS SENYAWA ALKALOID SA2014 DARI SPONS LAUT CINACHYRELLA ANOMALA TERHADAP PROTEIN P53 KANKER PAYUDARA T47D MENGGUNAKAN DOCKING MOLEKULER. Undergraduate thesis, Institut Teknologi Sepuluh Nopember Surabaya.

[img] Text
1512100011-Abstract.pdf - Published Version

Download (341kB)
[img] Text
1512100011-Conclusion.pdf - Published Version

Download (260kB)
[img] Text
1512100011-Undergraduate_Theses.pdf - Published Version

Download (1MB)

Abstract

p53 merupakan protein yang menginduksi terjadinya apoptosis ketika terjadi kerusakan DNA. Protein p53 yang mengalami mutasi terlibat pada lebih dari 50% pada kanker manusia dan berperan pada pembentukan kanker payudara. Riset untuk mendapatkan kandidat potensial obat antikanker yang sedikit menimbulkan efek samping umumnya diperoleh dari alam, salah satunya adalah spons laut. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui skor docking dan asam amino yang berperan dalam aktivitas senyawa alkaloid SA2014 terhadap protein p53. Penelitian ini menggunakan metode docking molekuler pada software PLANTS (Protein Ligand Ant System), preparasi protein menggunakan YASARA, preparasi ligan menggunakan Marvinsketch, validasi skor docking menggunakan Root Mean Square Deviation (RMSD) dan visualisasi menggunakan YASARA dan VMD (Visual Molecular Dinamic). Analisa data menggunakan skor docking dan jenis asam amino pada ikatan antara ligan dan protein target. Skor docking molekuler selanjutnya dibandingkan dengan doxorubicin yang berinteraksi dengan p53 pada kanker payudara T47D. Hasil penelitian menyatakan bahwa ligan SA2014 memiliki skor docking -52.0493 sedangkan doxorubicin -50.6343. Jenis asam amino yang dekat dengan interaksi antara senyawa alkaloid SA2014 dan protein p53 adalah leusin dan fenilalanin. Senyawa SA2014 memiliki kemampuan sebagai senyawa antikanker melawan kanker payudara T47D melalui interaksi asam amino leusin dan fenilalanin. Leusin berperan pada ikatan p53 dengan senyawa alkaloid SA2014 yang akan mempengaruhi ketahanan siklus sel pada fase G1/S dan memicu apoptosis. Fenilalanin berada pada interface interaksi p53 dan penting untuk menstabilkan struktur tetramerik melalui ikatan hidrogen.

Item Type: Thesis (Undergraduate)
Additional Information: RSBi 547.632 Lia a
Uncontrolled Keywords: alkaloid SA2014, Cinachyrella anomala, docking molekuler, kanker payudara T47D, protein p53.
Subjects: Q Science
R Medicine > R Medicine (General)
Divisions: Faculty of Mathematics and Science > Biology > (S1) Undergraduate Theses
Depositing User: FITRI LIANINGSIH
Date Deposited: 07 Nov 2016 07:48
Last Modified: 27 Dec 2018 02:17
URI: http://repository.its.ac.id/id/eprint/673

Actions (login required)

View Item View Item