Ekstraksi Data Irisan Gambar dari File DICOM Berjenis Multi-frame dan Sistem Registrasi Fiducial Image Tiga Dimensi dengan Penanda Huruf “W”

Sunandar, Muhamad Fikri (2023) Ekstraksi Data Irisan Gambar dari File DICOM Berjenis Multi-frame dan Sistem Registrasi Fiducial Image Tiga Dimensi dengan Penanda Huruf “W”. Other thesis, Institut Teknologi Sepuluh Nopember.

Text 05111940000135-Undergrduate_Thesis.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only until 1 October 2025. Download (6MB) | Request a copy

Abstract

Pencitraan medis adalah teknik dan proses pencitraan bagian dalam tubuh untuk analisis secara klinis fungsi dari organ atau jaringan tubuh. Standar digital yang digunakan untuk mengintegrasi semua informasi citra medis dinamakan Digital Imaging and Communications in Medicine (DICOM). Umumnya file DICOM bertipe single-frame dan multi-frame. Pada software BrainNAV, pembacaan citra medis file DICOM hanya bisa dilakukan pada file yang bertipe single-frame. Oleh karena itu, tujuan dari penelitian ini adalah untuk membangun algoritma yang dapat mengekstrak metadata dan gambar dari file DICOM multi-frame. Selanjutnya, gambar DICOM yang telah dibaca dapat disusun dalam bentuk 3D. Dengan data tersebut, dokter bisa melakukan perencanaan operasi pada kepala pasien. Akan tetapi, hasil scaning kepala pasien terkadang tidak pada kondisi ideal, bisa terjadi kemiringan atau pergeseran. Hal tersebut bisa menyebabkan perbedaan antara koordinat titik target pada software dan koordinat pada spasial fiducial. Oleh karena itu, untuk mengatasi hal tersebut perlu dilakukan sistem registrasi fiducial dengan alat stereotaktik BrainRY. Sistem ini akan menghasilkan nilai rotasi dan koordinat titik awal untuk mentranformasi koordinat software agar sesuai dengan koordinat pada spasial fiducial. Dataset yang digunakan pada skenario pengujian ini berjumlah lima buah dataset. Tiga dataset merupakan file DICOM bertipe multi-frame dan dua dataset digunakan untuk sistem registrasi fiducial. Pada ekstraksi data DICOM multi-frame skenario pengujian dilakukan dengan cara membaca dan menyusun gambarnya pada bentuk 3D. Sedangkan, pada registrasi fiducial skenario pengujian dilakukan dengan cara menghitung rata-rata error antara koordinat software dengan koordinat spasial fiducial. Hasil yang didapat dari semua skenario pengujian ini, metadata dan data gambar file DICOM multi-frame dapat diekstraksi dengan benar. Selain itu, penyusunan irisan gambar menjadi bentuk 3D juga bisa dilakukan dengan tepat. Selanjutnya, rata-rata error terbaik yang dihasilkan pada skenario pengujian sistem registrasi fiducial adalah 1.4 mm.
=================================================================================================================================
Medical imaging is the technique and process of imaging the inside of the body for clinical analysis of the function of organs or body tissues. The digital standard used to integrate all medical image information is called Digital Imaging and Communications in Medicine (DICOM). Generally, DICOM files are of single-frame and multi-frame types. In the BrainNAV software, the medical image reading from DICOM files can only be performed on single-frame files. Therefore, this study aims to build an algorithm that can extract metadata and images from multi-frame DICOM files appropriately. Then the medical images from the extracted DICOM file slices can be properly sequenced in 3D space. Furthermore, with this data, doctors can plan operations on the patient's head. However, the results of scanning the patient's head are sometimes not in ideal conditions, tilt or shift can occur. This can cause differences between point coordinates in the software and spatial fiducial coordinates. Therefore, to overcome this problem, it is necessary to implement a fiducial registration system with the help of stereotactic tools. This system will generate rotation values and starting point coordinates to transform software coordinates to match the fiducial spatial coordinates. The datasets used in this test scenario are five datasets. Three datasets are multi-frame type DICOM files and two datasets are used for fiducial registration systems. In multi-frame DICOM data extraction, the test scenario is carried out by reading and compiling the images in 3D form. Furthermore, in fiducial registration, the test scenario is carried out by calculating the average error between software coordinates and fiducial spatial coordinates. The results obtained in this test scenario, the metadata and image data of multi-frame DICOM files can be extracted correctly. In addition, the arrangement of image slices into 3D shapes can also be done precisely. Furthermore, the best average error generated in the fiducial registration system test scenario is 1.4 mm. In this case, it can be concluded that all objectives in this Final Project can be achieved properly.

Item Type:	Thesis (Other)
Uncontrolled Keywords:	BrainNAV, DICOM, Fiducial, Multi-frame, Registrasi, Stereotaktik
Subjects:	T Technology > T Technology (General) T Technology > T Technology (General) > T57.74 Linear programming T Technology > T Technology (General) > T58.6 Management information systems
Divisions:	Faculty of Intelligent Electrical and Informatics Technology (ELECTICS) > Informatics Engineering > 55201-(S1) Undergraduate Thesis
Depositing User:	Muhamad Fikri Sunandar
Date Deposited:	13 Nov 2023 03:21
Last Modified:	13 Nov 2023 03:21
URI:	http://repository.its.ac.id/id/eprint/101455

Actions (login required)

View Item