Kajian Pemilihan Metode Ekstraksi DNA Multiguna pada Sampel Pangan, Obat, dan Kosmetika

Khoiriah, Ulfah Lailatul (2025) Kajian Pemilihan Metode Ekstraksi DNA Multiguna pada Sampel Pangan, Obat, dan Kosmetika. Masters thesis, Institut Teknologi Sepuluh Nopember.

[thumbnail of 6008222005-Master_Thesis.pdf] Text
6008222005-Master_Thesis.pdf - Accepted Version
Restricted to Repository staff only until 1 April 2027.

Download (2MB) | Request a copy

Abstract

Isolasi DNA menjadi salah satu titik kritis dalam pengujian produk halal dalam bidang pangan, obat, dan kosmetika. Ekstraksi DNA diperlukan untuk memperoleh materi genetik yang akan diamplifikasikan menggunakan teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) guna mendeteksi kandungan DNA babi. Sebagian besar kit ekstraksi yang beredar di Indonesia merupakan hasil impor dan bersifat spesifik pada sampel tertentu. Dengan harga yang relatif tinggi kit komersial memiliki expired date yang berbeda dan singkat. Selain menggunakan kit komersial, ekstraksi DNA dapat dilakukan menggunakan metode konvensional dengan memodifikasi buffer lisis menggunakan Tris EDTA, Cetyl Trimethylammonium Bromide (CTAB), Salt, Alkaline, dan Urea. Penelitian ini menunjukkan bahwa metode konvensional dengan penambahan urea pada buffer lisis dapat menjadi solusi multiguna untuk berbagai jenis sampel, seperti produk pangan, obat, dan kosmetika. Hasil ekstraksi berbasis kit pada sampel daging babi, sosis babi, obat, dan kosmetik terbukti menghasilkan konsentrasi DNA yang lebih tinggi dengan persentase 100% dibandingkan dengan metode konvensional. Namun, metode konvensional dengan modifikasi buffer lisis dengan penambahan urea menghasilkan konsentrasi DNA yang cukup kompetitif, yakni 119 ng untuk daging babi, 100,05 ng untuk sosis babi, 0,357 ng untuk obat dan 0,632 ng untuk kosmetik. Hasil ini menunjukkan bahwa metode ini memiliki potensi untuk dikembangkan lebih lanjut sebagai metode ekstraksi DNA yang lebih terjangkau. Penelitian ini memberikan kontribusi dalam pengembangan teknologi pengujian produk halal yang mendukung kemandirian dan ketahanan pangan nasional.
====================================================================================================================================
DNA isolation is one of the critical points in testing halal products in the fields of food, medicine, and cosmetics. DNA extraction is needed to obtain genetic material that will be amplified using the Polymerase Chain Reaction (PCR) technique to detect the DNA content of pigs. Most of the extraction kits circulating in Indonesia are imported and specific to certain samples. With a relatively high price, commercial kits have different and short expiration dates. In addition to using commercial kits, DNA extraction can be performed using conventional methods by modifying the lysis buffer using Tris EDTA, Cetyl Trimethylammonium Bromide (CTAB), Salt, Alkaline, and Urea. This study shows that the conventional method of adding urea to the lysis buffer can be a multipurpose solution for various types of samples, such as food products, drugs, and cosmetics. Extraction results using a kit-based method on pork meat, pork sausage, medicine, and cosmetics have been proven to yield higher DNA concentrations with a 100% success rate compared to conventional methods. However, the conventional method with modified lysis buffer with the addition of urea produced a fairly competitive DNA concentration, namely 119 ng for pork, 100.05 ng for pork sausage, 0.357 ng for medicine and 0.632 ng for cosmetics. These results suggest that this method has the potential to be further developed as a more affordable method of DNA extraction. This research contributes to the development of halal product testing technology that supports national food independence and security.

Item Type: Thesis (Masters)
Uncontrolled Keywords: Deoxyribonucleic Acid (DNA); Extraction; Food; Halal; Multipurpose Method; Deoxyribonucleic Acid (DNA); Ekstraksi; Halal; Metode Multiguna; Pangan
Subjects: T Technology > TP Chemical technology > TP248.3 Biochemical engineering. Bioprocess engineering
Divisions: Faculty of Industrial Technology and Systems Engineering (INDSYS) > Chemical Engineering > 24101-(S2) Master Thesis
Depositing User: Ulfah Lailatul Khoiriah
Date Deposited: 03 Feb 2025 01:19
Last Modified: 03 Feb 2025 01:19
URI: http://repository.its.ac.id/id/eprint/117770

Actions (login required)

View Item View Item