Biokonjugasi Rna Aptamer Sebagai Sistem Pengiriman Obat Kemoterapi Sn38 Pada Lini Sel Kanker Kolorektal Hct116

Avionita, Faradilla (2026) Biokonjugasi Rna Aptamer Sebagai Sistem Pengiriman Obat Kemoterapi Sn38 Pada Lini Sel Kanker Kolorektal Hct116. Masters thesis, Institut Teknologi Sepuluh Nopember.

Text 6005241001-Master_Thesis.pdf - Accepted Version Restricted to Repository staff only Download (5MB)

Abstract

SN38 merupakan metabolit aktif irinotekan yang memiliki aktivitas antikanker yang tinggi melalui penghambatan enzim topoisomerase I, enzim yang berperan dalam proses replikasi DNA, namun aplikasinya terbatas karena kelarutan air yang sangat rendah sehingga secara klinis harus diberikan dalam bentuk prodrug irinotekan. Penelitian ini bertujuan mengembangkan sistem penghantaran berbasis RNA aptamer untuk meningkatkan kelarutan, spesifisitas, dan efikasi SN38 terhadap sel kanker kolorektal. SN38 terlebih dahulu dikonjugasikan dengan linker azida agar dapat dikonjugasikan dengan dua strand RNA yang dimodifikasi pada posisi 2′-gula ribosa melalui reaksi click chemistry, sehingga menghasilkan konjugat RNA–SN38 yang secara signifikan meningkatkan kelarutan SN38 dalam media air. Konjugat RNA–SN38 dihibidrisasi membentuk dimer RNA, yang dikonfirmasi melalui analisis PAGE gel. Untuk meningkatkan spesifisitas terhadap sel kanker, salah satu strand RNA dikombinasikan dengan aptamer yang memiliki afinitas tinggi terhadap reseptor Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) yang berekspresi tinggi pada sel kanker kolorektal. Uji sitotoksisitas menunjukkan SN38 terkonjugasi RNA aptamer secara signifikan menurunkan viabilitas lini sel kanker kolorektal HCT116, dimana efikasi RNA aptamer–SN38 meningkat hingga 3,6 kali dibandingkan SN38 bebas. Sedangkan pada lini sel kanker normal MCF10A tidak menunjukkan toksisitas yang signifikan. Analisis apoptosis menunjukkan peningkatan persentase kematian sel sebesar 2,8 kali pada sel HCT116 yang diberi perlakuan SN38 terkonjugasi RNA aptamer. Studi ikatan dan internalisasi sel menggunakan mikroskop konfokal menunjukkan bahwa SN38 terkonjugasi RNA aptamer terinternalisasi lebih efisien ke dalam sel kanker dibandingkan SN38 bebas. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa konjugat SN38–RNA aptamer merupakan sistem penghantaran obat yang selektif, aman terhadap sel sehat, dan berpotensi tinggi untuk terapi kemoterapi kolorektal, khususnya dalam meningkatkan kelarutan dan efikasi obat hidrofobik pada terapi kanker kolorektal.
===============================================================================================================================
SN38 is the active metabolite of irinotecan that exhibits potent anticancer activity through inhibition of topoisomerase I, a key enzyme involved in DNA replication; however, its clinical application is limited by extremely poor aqueous solubility, requiring delivery in the form of the prodrug irinotecan. This study aimed to develop an RNA aptamer–based delivery system to enhance the solubility, specificity, and therapeutic efficacy of SN-38 against colorectal cancer cells. SN38 was first functionalized with an azide linker and subsequently conjugated to two 2′- ribose–modified RNA strands via click chemistry, yielding RNA–SN38 complexes with markedly improved aqueous solubility. The RNA–SN38 conjugates were hybridized to form RNA dimers, as confirmed by PAGE analysis. To improve cancer cell specificity, one RNA strand was engineered with an aptamer exhibiting high affinity toward the epidermal growth factor receptor (EGFR), which is overexpressed in colorectal cancer cells. Cytotoxicity assays demonstrated that the RNA aptamer–SN38 conjugate significantly reduced the viability of HCT116 colorectal cancer cells, with a 3.6-fold increase in efficacy compared to free SN-38, while showing minimal toxicity toward normal MCF10A cells. Apoptosis analysis revealed a 2.8-fold increase in cell death, and confocal microscopy confirmed enhanced cellular binding and internalization of the conjugate compared to free SN38. These findings indicate that the SN38–RNA aptamer conjugate represents a selective, safe, and highly promising delivery system for colorectal cancer therapy, particularly for improving the solubility and efficacy of hydrophobic anticancer drugs.

Item Type:	Thesis (Masters)
Uncontrolled Keywords:	RNA, Aptamer, SN38, Kolorektal, HCT116 RNA, Aptamer, SN38, Colorectal, HCT116
Subjects:	Q Science > QH Biology Q Science > QH Biology > QH301 Biology
Divisions:	Faculty of Science and Data Analytics (SCIENTICS) > Biology > 46101-(S2) Master Thesis
Depositing User:	Faradilla Avionita
Date Deposited:	28 Jan 2026 08:52
Last Modified:	28 Jan 2026 08:52
URI:	http://repository.its.ac.id/id/eprint/131002

Actions (login required)

View Item